亚博直营网网站显示空白页面_生物成品表征之卵白质N端序列分析

发布日期:2024-02-15 07:47    点击次数:76
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跟着当代医药工业的发展,卵白质药物变得备受柔柔,而卵白质药物的N端序列分析关于医药工业来说短长常困难的信息。N-端序列与卵白质的功能和踏实性息息相关,对卵白质进行N-端测序分析,不错详情卵白质的开头,有意于匡助分析卵白质的高档结构,揭示卵白质的生物学功能。

百泰派克生物科技BTP为您提供多种卵白质N端序列分析技艺奇迹,基于Edman降解法的卵白质N端序列检测、基于高分辨质谱法的卵白质N端序列检测,详见如下先容:

一、基于Edman降解法的卵白质N端序列分析

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1. 旨趣:

Edman测序反馈是一个轮回进程,即在弱碱性要求下使多肽/卵白与异硫氰酸苯酯(PITC)反馈,然后用酸不休,从多肽链上仅使氨基结尾残基以氨基酸的苯基乙内酰硫脲养殖物的款式游离出来,然后对分离出的氨基酸进行已然。

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2. 本质仪器:

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全自动卵白质/多肽测序仪(PPSQ33A)

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3. 愚弄:

Edman降解法测定卵白质N端序列,通过跑胶转模大略点膜的形势进行样品不休,不错平直分析氨基酸信息,不需要任何卵白质数据库就不错准确分析N端氨基酸序列,尽头是能别离异亮氨酸和亮氨酸、谷氨酰胺和赖氨酸。然则Edman降解法的通量低,况兼不适用于N端已被化学修饰或顽固的卵白大略多肽不可用。

4. 效果展示:

为对19种PTH-氨基酸进行校准,故先测试19种PTH氨基酸的搀杂轨范品,校准测试搀杂轨范品图谱如下:

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轨范品校准测试图谱

PTH氨基酸搀杂轨范品校准测试完成后,测试样品的N-端序列,样品测试图谱如下:

N端第1位

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N端第2位

N端第3位

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通过上述图谱不错详情卵白质N端序列为Tyr-Val-Trp。

二、基于高分辨质谱法的卵白质N端序列检测

1. 旨趣:

20世纪80年代末发展的电喷雾电离(ESI)使质谱技艺在卵白质结构分析上的愚弄发生了调动性飞跃。关于基于高分辨质谱法的N端测序,样品经过SDS-PAGE分离沟通卵白后使用卵白酶酶解,酶解后产的产品用Q-Exactive系列质谱仪(Thermo Fisher Scientific)进行质谱分析,肽段在质谱中离散得到b、y离子的二级质谱图,通过图谱与卵白表面氨基酸序列比对详情卵白质的N端位置。

2. 本质仪器:

高效液相色谱串联质谱仪:高效液相色谱仪-Easy-nLC 1200;电喷雾-组合型离子阱Orbitrap 质谱仪-Q Exactive™ Hybrid Quadrupole-Orbitrap™ Mass Spectrometer。

3. 愚弄:

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基于高分辨质谱法的N端测序,不错通过高分辨率质谱分析N端顽固和翻译后修饰(PTMs),从而详情卵白质N端开头。关于复杂的卵白,我司援手对复杂卵白进行N端二甲基化标记,通过分析标记位置详情复杂卵白样品中的多个卵白的N端开头。

4. 效果展示:

卵白药物样品的N端氨基酸序列分析:

Trypsin酶解后的样品经过LC-MS/MS分析后得到质谱数据,质谱数据经过与表面数据库匹配,得到和表面N端序列(HYAHVDCPGHADYVK)相适当的MS2图谱,图谱如下:

N端序列二级质谱图

通过以上分析不错得出此卵白药物的N端肇端氨基酸为组氨酸,N端序列为HYAHVDCPGHADYVK。

常见问题:

问题1:Edman降解法和质谱法检测卵白质N端的优点与时弊?

复兴:

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质谱法:

优点:

1.能赢得更长的N端序列信息;

2.可分析N端顽固和PTMs。

时弊:

1.等重的氨基酸不可详情;

2.肽序列的障翳率很少是100%。

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Edman降解法:

优点:

1.不错准确分析N端氨基酸序列,尽头是能别离异亮氨酸和氨酸、谷氨酰胺和赖氨酸;

2.平直分析氨基酸信息,不需要任何卵白质数据库,不错识别未登记在数据库中的未知卵白质。

时弊:

1. N端已被化学修饰或顽固的肽不可用;

2. 低通量分析。

问题2:N端发生修饰的卵白何如详情其N端位置?

复兴:

在数据分析时同期分析N端的PTMs重庆时时彩娱乐城,分析已然出有修饰的N端位置。